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Nat Commun丨刘瑾团队开发创新RNA速度分析方法SDEvelo

BioArt 2025-01-06 17:30
文章摘要
本文介绍了香港中文大学（深圳）刘瑾团队与武汉大学焦雨领团队合作开发的一种新型RNA速度分析方法SDEvelo，该方法通过多变量随机微分方程建模，解决了现有RNA速度分析技术在预测细胞发育动态过程中的不足。SDEvelo的创新之处在于首次引入多变量随机微分方程模型，采用非线性可微函数描述转录率变化，并充分考虑转录过程中的随机波动。该方法在成熟细胞群体中有效缓解了现有方法的错误预测问题，并在肝细胞癌的空间转录组学数据分析中展示了其应用潜力。此外，SDEvelo在小鼠胚胎重编程数据中的应用也显示了其在发育生物学领域的广泛适用性。
Nat Commun丨刘瑾团队开发创新RNA速度分析方法SDEvelo
查看文献： Multivariate stochastic modeling for transcriptional dynamics with cell-specific latent time using SDEvelo.
查看期刊：Nature Communications
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