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南开大学提出PGAT-ABPp模型，通过蛋白质语言模型和图注意力网络识别抗菌肽

智药邦 2024-08-26 09:00
文章摘要
南开大学邵学广教授和蔡文生教授团队提出了一种新的深度学习方法PGAT-ABPp，用于识别抗菌肽（ABP）。该方法结合了AlphaFold2预测的结构和预训练的蛋白质语言模型ProtT5，通过图注意力网络（GAT）学习全局判别特征，显著提高了预测性能。实验结果显示，PGAT-ABPp在多个评估指标上优于现有模型。该研究不仅提高了ABP识别的准确性，也为后续的ABP设计和实验策略提供了有力支持。
南开大学提出PGAT-ABPp模型，通过蛋白质语言模型和图注意力网络识别抗菌肽
查看文献： Short-read aligner performance in germline variant identification.
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