文献互助智能选刊最新文献

高级搜索发布求助登录注册

首页 > 医学

文献分享｜Science Advance｜SpaTopic：用于从空间转录组数据中探索肿瘤空间结构的统计学习框架

杨朝勇课题组 2024-11-27 08:30

文章摘要

本文介绍了一种名为SpaTopic的统计学习框架，该框架通过整合单细胞转录组数据与空间转录组数据，实现了空间spot聚类与细胞类型解卷积的统一。文章背景介绍了肿瘤微环境（TME）中肿瘤组织的复杂空间结构，以及空间转录组学在揭示TME细胞和分子层级空间结构上的潜力。研究目的在于提出一种新的统计学习方法，通过主题建模揭示复杂组织中的空间功能单元。结论部分展示了SpaTopic在胰腺导管癌、原发性肝癌和结直肠癌等肿瘤类型中的应用，证明了其在识别肿瘤微环境中的特定功能区域和预测三级淋巴结构方面的有效性。

文献分享｜Science Advance｜SpaTopic：用于从空间转录组数据中探索肿瘤空间结构的统计学习框架

查看文献： SpaTopic: A statistical learning framework for exploring tumor spatial architecture from spatially resolved transcriptomic data
查看期刊：Science Advances

本站注明稿件来源为其他媒体的文/图等稿件均为转载稿，本站转载出于非商业性的教育和科研之目的，并不意味着赞同其观点或证实其内容的真实性。如转载稿涉及版权等问题，请作者速来电或来函联系。

推荐文献

Science Bulletin

Science Bulletin

Complex terrain causes global model prediction biases of 21.7 Zhengzhou extreme precipitation

DOI: 10.1016/j.scib.2025.09.015 Pub Date : 2026-01-30

IF 21.1 1区综合性期刊 Q1

Science Bulletin

iScience

iScience

Erratum: Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition.

DOI: 10.1016/j.isci.2026.114722 Pub Date : 2026-01-22 Date: 2026/2/20 0:00:00

IF 4.1 2区综合性期刊 Q1

iScience

Science Advances

Science Advances

Extracellular vesicles mediate stem cell signaling and systemic RNAi in planarians

DOI: 10.1126/sciadv.ady1461 Pub Date : 2026-02-06

IF 13.6 1区综合性期刊 Q1

Science Advances

最新文章

跨越新的台阶！2篇《Science》实现“蛋白质编辑”

跨越新的台阶！2篇《Science》实现“蛋白质编辑”

iNature在自然的细胞环境中研究蛋白质对于我们理解生物学至关重要。2025年5月1日，宾夕法尼亚大学George M. Burslem团队在Science 在线发表题为“Intracellular

9小时前

华东师范大学董开武团队：光催化对映选择性氢胺化/环化反应

华东师范大学董开武团队：光催化对映选择性氢胺化/环化反应

手性 3,4 - 二氢异喹啉酮作为异喹啉生物碱的重要类别，是天然产物、药物及生物活性化合物中广泛存在的核心骨架。同时，它也是 1,2,3,4 - 四氢异喹啉生物碱不对称全合成的关键中间体。科研人员已为

9小时前

$Lancet子刊\u00A0|\u00A0张慧东/侯青芝/吴琳琳合作：环境中的抗生素环丙沙星通过导致滋养层细胞衰老而引发不明病因流产$

Lancet子刊\u00A0|\u00A0张慧东/侯青芝/吴琳琳合作：环境中的抗生素环丙沙星通过导致滋养层细胞衰老而引发不明病因流产

近日，张慧东教授团队和侯青芝教授团队以及吴琳琳教授团队合作，在国际综合性期刊、Lacent子刊eBioMedicine（中科院一区Top期刊，影响因子10.8）发表了题为：“Environmental

9小时前

Genome Biology | AI 解锁植物“隐藏肽”：FungiGuard挖掘非经典开放阅读框的抗真菌小肽新功能

Genome Biology | AI 解锁植物“隐藏肽”：FungiGuard挖掘非经典开放阅读框的抗真菌小肽新功能

真菌病害长期依赖化学杀菌剂防控，但过度使用造成环境污染、农药残留和病原菌耐药，制约绿色农业发展。抗真菌肽是植物体内天然存在的小分子肽，能够帮助植物抵抗真菌侵袭，是作物抗病育种与生物农药研发的重要来源。

9小时前

Book学术官方微信

Book学术文献互助

Book学术文献互助群
群号：604180095

文献互助智能选刊最新文献互助须知联系我们：info@booksci.cn

Book学术提供免费学术资源搜索服务，方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。

Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.

京公网安备 11010802042870号京ICP备2023020795号-1