Nat Microbio | 苏建忠团队开发单细胞水平遗传算法揭示宿主遗传-菌群-细胞类型内在关联性

该研究开发了创新计算框架scBPS，整合宏基因组GWAS与人类多器官单细胞转录组数据，首次系统绘制了肠道菌群与宿主细胞群体间的互作网络。研究发现肠道菌群与宿主组织存在模块化关联，特别是肝上皮细胞与菌群的关联性最为显著，其中中央静脉肝细胞亚群与Collinsella的关联强度显著高于门静脉周围肝细胞。进一步分析表明，Collinsella通过调控中央静脉肝细胞的胆固醇代谢通路影响宿主血脂水平。这一研究填补了宿主遗传-菌群-细胞类型三维关联解析的空白，为疾病机制研究与干预策略提供了新方向。