天津医科大学贾书磊/江苏海洋大学杨光团队《ImetaOmics》：BioMGCore—在复杂微生物组中批量提取生物代谢基因簇

本研究由天津医科大学贾书磊副教授与江苏海洋大学杨光副教授合作，开发了一个名为BioMGCore的工具包，用于在复杂微生物组中批量提取生物代谢基因簇（MGCs）。该工具基于关键词匹配和基因邻近原则，能够从gutSMASH或antiSMASH的注释结果中高效识别和提取MGCs，实现数据降维，有助于探索微生物中的初级和次级代谢物。研究背景指出微生物代谢物对人体健康的重要性，以及现有工具在处理大规模基因组数据时的局限性。BioMGCore通过分类系统和严格的基因邻近判断逻辑，提高了基因簇提取的准确性和效率。实验结果表明，该工具在多个细菌基因组中成功提取了目标基因簇，并在微生物组分析中显示出广泛的应用潜力。结论认为BioMGCore是一个快速且准确的辅助工具，可用于微生物功能分析和代谢物研究，未来将继续升级以保持在研究前沿。