Research|基于单分子成像数据解析HIV-1的转录启动和延伸—中山大学张家军教授团队新进展

本研究由中山大学张家军教授团队与广东金融学院杨喜艳副教授合作，开发了一个基于单分子成像数据和随机动力学机制模型双驱动的框架，用于解析HIV-1的转录启动和延伸过程。研究背景指出，HIV-1的转录启动与延伸是调控病毒潜伏与激活的关键环节，但现有方法难以捕捉动态特征。研究通过构建涵盖转录启动与延伸的HIV-1转录模型，并基于单分子成像技术获取时间序列数据，提出了一种整合nascent RNA数据与启动时间数据的推断方法。研究结果表明，结合启动时间数据能显著提高模型的可辨识性，并精确推断出启动速率和延伸时间。此外，活细胞实验数据分析证实了病毒蛋白Tat在转录启动和延伸中的双重作用。该研究为深入理解HIV-1潜伏期调控机制及优化抗病毒治疗策略提供了新的思路和方法。