贝叶斯系统发育混合模型案例及code｜Bayesian statistics

本文研究了与丛枝菌根真菌（AM）和外生菌根真菌（EM）相关的木本植物在六个关键植物性状上的系统差异，包括绿色和衰老叶片的氮、磷浓度以及根系的氮、磷浓度。研究背景基于植物营养经济与菌根关联的关系，并考虑了纬度带（寒带、温带和热带）的交互作用。研究目的是探究菌根效应如何随纬度变化，并评估植物生长形式和固氮状态的影响。通过贝叶斯系统发育混合模型，研究避免了近缘物种的过度计数，并传播了不确定性。研究结论表明，菌根关联对植物性状的影响在不同纬度带中存在显著差异，且系统发育信号在预测性状值中起重要作用。