Nat Commun | 西南大学宋佳明等团队通过转座因子插入多态性的全基因组分析揭示了水稻耐寒性的潜在特征

该研究通过全基因组分析165个水稻种质的转座因子插入多态性(TIP)，揭示了转座因子(TE)在水稻耐寒性中的重要作用。研究发现30,316个TIP位点，并发现多态性TE(pTE)在冷胁迫下表现出H3K27me3富集增加，表明其在表观遗传调控中的潜在作用。研究还鉴定出26,914个对冷胁迫响应的TE，并通过TIP-GWAS分析发现了两个耐寒基因OsCACT和OsPTR，其功能通过实验验证。这些发现为培育耐寒水稻品种提供了新的靶基因，并展示了pTE在作物改良中的潜力。