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文献分享|PTM-Mamba：一种具有双向门控 Mamba 模块的翻译后修饰感知蛋白质语言模型

林木多组学研究 2025-08-21 14:32
文章摘要
背景：翻译后修饰（PTM）如磷酸化、乙酰化等对蛋白质功能多样性至关重要，其失调与多种疾病相关。现有蛋白质语言模型（如ESM-2）未涵盖PTM表征。研究目的：开发PTM-Mamba模型，通过双向门控Mamba模块融合PTM标记与ESM-2嵌入，实现对野生型和PTM序列的联合建模。结论：模型在疾病预测、药物性评估和零样本PTM发现任务中优于基线模型，成为PTM感知蛋白质建模的基础工具，为精准医学提供新范式。
文献分享|PTM-Mamba：一种具有双向门控 Mamba 模块的翻译后修饰感知蛋白质语言模型
查看文献： PTM-Mamba: a PTM-aware protein language model with bidirectional gated Mamba blocks
查看期刊：Nature Methods
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