bioRxiv.: 利用 RFdiffusion2 进行原子级别酶活性位点支架设计

背景：酶在生命过程和工业应用中具有高度选择性和高效催化性能，但传统酶设计方法依赖专家经验或有限结构模板。研究目的：利用RFdiffusion2模型在原子分辨率下直接对酶活性位点进行支架化设计，提高设计灵活性与成功率。结论：实验证明RFdiffusion2在计算基准测试中超越现有方法，能生成具有体外催化活性的功能性酶，其设计的新酶结构不同于PDB中所有已知结构，为从头酶设计开辟了新途径，但催化效率仍低于天然酶，未来需改进theozyme定义、神经网络架构和共设计策略。