南京农业大学沈其荣院士团队在Nature Communications发表研究成果，突破三代宏基因组分箱的共性关键技术

本研究针对环境微生物组中物种构成复杂、未知物种多、高质量基因组难获取等共性难题，开发了针对三代宏基因组的长读分箱智能算法LorBin。该工具通过多尺度自适应聚类和评估技术，结合无监督深度学习，显著提升了基因组重构的质量和数量，能够更有效地挖掘新物种和识别环境中的致病菌及耐药基因。基准测试显示，LorBin在分箱质量和捕获稀有物种方面优于现有工具，重构的高质量单菌基因组数量增加15–189%，特有物种识别数量提升2.4–17倍。该研究为复杂微生物群落分析提供了高效工具，适用于农业、环境和医学领域的微生物组研究。