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林木多组学研究 2025-11-26 22:49
文章摘要
本研究基于全球75种不同生境的63410个宏基因组和87920个分离菌株基因组，构建了包含9.65亿个非冗余小开放阅读框（smORF）的全球微生物目录（GMSC）。研究背景在于smORF广泛存在于微生物中但生态分布和功能未知，研究目的旨在系统揭示smORF的多样性特征和功能潜力。主要发现包括：仅4.5%的smORF被确认为高质量序列，其中古菌的smORF密度显著高于细菌；功能注释显示超90%的smORF缺乏已知功能域，古菌与细菌的跨膜蛋白分布存在显著差异；研究还开发了GMSC-mapper工具以提升smORF预测可靠性。结论表明微生物smORF具有巨大未开发多样性，为微生物功能研究提供了重要资源。
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查看文献： A catalog of small proteins from the global microbiome
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