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文献分享 | 利用DNA和蛋白质大语言模型高效识别玉米有害突变

林木多组学研究 2025-12-14 20:28
文章摘要
本研究以玉米优良自交系Chang7-2为背景，旨在解决如何从海量遗传变异中高效精准筛选有害突变这一功能基因组学瓶颈问题。研究通过构建染色体水平的Chang7-2参考基因组，并创制了包含超过250万个EMS诱变位点的大规模突变体库。研究目的包括利用DNA大语言模型PlantCAD和蛋白质大语言模型ESM1b对这些突变进行功能效应预测，以精准鉴定有害突变，并关联分析重要农艺性状。研究结论表明，两种大语言模型能高效互补地识别有害突变，包括传统方法难以评估的非编码突变，并成功应用于白化叶、雄性不育等多个性状的致因突变鉴定，为玉米功能基因组研究和分子设计育种提供了宝贵的资源和技术路径。
文献分享 | 利用DNA和蛋白质大语言模型高效识别玉米有害突变
查看文献： Large DNA and protein language models enhance discovery of deleterious mutations in maize.
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