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阅读 Nature | 金属水解酶的计算设计

南海CSG 2025-12-16 08:00
文章摘要
背景:金属水解酶在环境污染物降解等领域应用前景广阔,但现有从头设计方法常因活性中心构建受限而导致酶活性较低。研究目的:为突破传统设计限制,研究团队开发了RFdiffusion2生成模型,旨在实现无需预设序列位置和主链坐标、直接基于量子化学过渡态构型进行高活性金属水解酶的从头设计。结论:通过结合RFdiffusion2与PLACER筛选策略,成功设计出催化效率接近定向进化水平的新型锌金属水解酶(如ZETA_2),其晶体结构与设计模型高度吻合。该研究确立了“Zero-shot”酶设计新范式,无需后续定向进化即可直接获得高效催化剂,为开发新型生物催化剂开辟了新道路。
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