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JIPB | 中国水稻研究所张健团队研发第二代高通量蛋白互作组鉴定技术TDOP-seq
JIPB
2025-12-25 12:37
文章摘要
背景:蛋白质相互作用(PPIs)是细胞功能的基础,跨物种蛋白质相互作用组分析对理解宿主-病原体互作及拓展模式生物功能信息至关重要。拟南芥和水稻是重要模式物种,但水稻许多蛋白功能尚未解析。研究目的:中国水稻研究所张健团队旨在开发高效、低成本的跨物种蛋白质互作鉴定技术,以加速水稻功能蛋白组研究。结论:团队成功开发第二代高通量蛋白互作组鉴定技术TDOP-seq,整合Touch-down、重叠PCR和HiFi三代测序策略,实现“诱饵”与“猎物”蛋白cDNA的高效拼接,步骤简化、时间缩短。该技术在水稻与拟南芥跨物种互作研究中鉴定出7726对蛋白互作组合,验证了其高效性,并成功预测解析多个水稻未知功能蛋白,在宿主-病原体互作、作物遗传改良等领域具应用潜力。
查看文献:
Interspecies rice versus Arabidopsis thaliana protein-protein interactome profiling by touch-down overlapping PCR coupled with HiFi long-read sequencing.
查看期刊:
Journal of Integrative Plant Biology
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