Advanced Science | 刘永鑫/李小方/陈夏/陈同等发布微生物组PacBio与Nanopore长读扩增子分析流程

背景：第三代测序技术（如PacBio和Nanopore）因其长读长优势，在微生物组研究中能提供更高的分类分辨率，但缺乏简便、可重复且社区支持的全长扩增子数据分析流程。研究目的：为弥补这一不足，研究团队对广泛使用的EasyAmplicon流程进行升级，开发了EasyAmplicon 2，旨在提供一个全面支持PacBio和Nanopore等长读扩增子数据的一站式分析解决方案。结论：EasyAmplicon 2是一个模块化、用户友好的流程，整合了质量控制、去噪、分类注释、多样性分析和可视化等功能。它支持多平台数据，在物种注释准确性上优于其他现有流程，并提供了30多种可定制可视化图表，显著降低了长读扩增子数据分析的门槛，有助于推动微生物生态学、临床医学等相关领域的高分辨率研究。