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iMeta高引论文 | 刘永鑫/陈同/李国梁/陈实富/文涛-EasyMetagenome: 用户友好且灵活的宏基因组测序数据分析流程

iMeta 2026-01-17 19:00

文章摘要

背景：鸟枪法宏基因组测序已成为微生物组研究的关键技术，但数据处理复杂且可重复性挑战突出。研究目的：开发一个用户友好且灵活的标准化分析流程EasyMetagenome，以支持全面的宏基因组数据分析，包括质量控制、宿主去除、基于读长和组装的分析、分箱及基因组分析，并提供可自定义设置与可视化。结论：EasyMetagenome流程有效提升了宏基因组数据分析的标准化和可重复性，未来将致力于整合三代测序数据分析和深度学习等前沿技术，进一步优化微生物组研究的洞察力与准确性。

iMeta高引论文 | 刘永鑫/陈同/李国梁/陈实富/文涛-EasyMetagenome: 用户友好且灵活的宏基因组测序数据分析流程

查看文献： EasyMetagenome: A user-friendly and flexible pipeline for shotgun metagenomic analysis in microbiome research
查看期刊：iMeta

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