iMeta高引论文 | 福建农林朱方捷/王琴组揭示同源二聚化解决TF“特异性悖论”的新机制

本研究背景聚焦于真核转录因子（TFs）面临的“特异性悖论”，即它们识别的DNA基序较短，理论上可结合大量基因组位点，但实际需特异性调控的基因数量有限，且同家族旁系同源TFs具有高度相似的结合序列却需实现功能分化。研究目的是通过高通量SELEX技术系统性解析40个VIII亚家族R2R3-MYBs的DNA序列特异性，探究旁系同源TFs实现靶向特异性的机制。结论表明，同源二聚化不仅能通过二聚体构象（取向/间距）区分旁系同源TFs，还能直接改变TF识别的DNA基序，产生独特的结合特异性。以AtMYB2为例，其二聚化后特异性发生改变，识别独有的顺式元件（如ER1a），这些元件在进化中保守且能特异性激活下游基因转录。这为解决转录因子“特异性悖论”提供了新机制，即同源二聚化通过改变序列特异性实现旁系同源TFs的功能区分。