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iMeta高引论文 | 电子科技大学林昊/吕昊等-从DNA复制视角预测癌症三维染色质结构

iMeta 2026-02-12 19:00
文章摘要
背景：三维基因组染色质互作在基因调控中起关键作用，但现有实验方法成本高且复杂，难以大规模应用。研究目的：开发一个仅利用DNA复制时序（RT）信号预测增强子-启动子互作（EPIs）的可解释机器学习模型RepliChrom，以降低预测成本并揭示癌症相关染色质结构。结论：RepliChrom在多种细胞系和测序平台（如Hi-C、ChIA-PET）中表现出稳健的预测能力和泛化性，成功识别了白血病特异性EPIs模式，为癌症生物标志物发现提供了新思路。
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查看文献： RepliChrom: Interpretable machine learning predicts cancer-associated enhancer-promoter interactions using DNA replication timing
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