Nat Commun | 郭燕等团队构建关节遗传剪接调控图谱，揭示关节相关复杂性状的组织特异性机制

本研究由西安交通大学郭燕教授团队与西安市红会医院合作，针对软骨和滑膜等关节核心组织，旨在通过构建遗传剪接调控图谱，揭示关节相关复杂性状（如骨关节炎、类风湿关节炎及身高）的组织特异性分子机制。背景在于，全基因组关联研究鉴定的风险变异多位于非编码区，其功能机制不明，传统eQTL分析解释力有限，而遗传变异对RNA可变剪接的调控作用日益受到关注。研究整合了238名供体的转录组与基因型数据，系统分析了软骨和滑膜中的剪接数量性状位点，鉴定出大量独立cis-sQTL信号及组织特异性信号，并利用深度学习模型预测了高可信度功能变异。结论表明，关节组织中的剪接调控与表达调控在很大程度上相互独立，sQTL信息能补充eQTL，更全面解析遗传机制；研究进一步通过共定位分析，鉴定出多个关节相关疾病的效应基因，其中部分表现出组织特异性，证明组织特异性可变剪接是连接遗传变异与关节表型的关键分子桥梁。该工作为理解非编码变异的功能及疾病靶点挖掘提供了新视角。