Nat Cancer | 王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱，揭示肝细胞癌微环境空间异质性
BioArt
2024-09-28 09:48
文章摘要
王红阳/陈磊团队在Nature Cancer发表的研究论文，通过CODEX技术绘制了肝细胞癌（HCC）单细胞空间蛋白图谱，揭示了HCC微环境的空间异质性。研究对401名HCC患者的肿瘤样本进行了36种抗体染色，分辨率达0.377 μm/pixel，共获得4,347,731个细胞，定义了72个细胞表型及40个细胞邻域关系。通过非监督聚类，研究定义了三种主要的微环境空间构成模式，这些模式能较准确地区分患者预后。此外，研究还发现Vimentin高表达的巨噬细胞与Treg细胞的空间互作促进HCC恶性进展，并与患者免疫治疗反应性显著正相关。该研究为理解HCC的微环境异质性及其对治疗反应的影响提供了新的视角。
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