PNAS｜谢晓亮课题组开发出基于双链脱氨酶的转录因子印迹技术FOODIE

谢晓亮课题组在PNAS上发表的研究论文介绍了一种名为FOODIE的新技术，该技术基于双链DNA脱氨酶，能够在单分子和单细胞水平上实现全基因组转录因子结合图谱的绘制。传统的转录因子结合检测方法存在多种限制，如抗体依赖性、高成本和低分辨率等。FOODIE技术通过将胞嘧啶转化为尿嘧啶，并在PCR扩增和二代测序后检测胸腺嘧啶，从而实现对转录因子结合位点的高分辨率检测。该方法具有低成本、高扩展性和高分辨率的优势，适用于单细胞分析，并能解析异质性组织中的转录因子结合模式。研究还发现，转录因子在基因组上的结合表现出更多的正向协同作用，这有助于理解基因调控机制。FOODIE技术的开发为研究哺乳动物细胞的转录调控提供了新的工具，并有望在疾病研究中发挥重要作用。