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Nat Commun | 毕文健/岳伟华/张培培团队开发出分析纵向数据表型的GWAS新算法

BioArt 2025-02-09 17:30
文章摘要
本文介绍了北京大学与北京大学第六医院的毕文健/岳伟华/张培培合作团队在Nature Communications期刊上发表的一项新研究,该研究开发了一种名为SPAGRM的新算法,用于分析纵向数据表型的全基因组关联研究(GWAS)。纵向数据表型能够表征健康状况的动态演变规律,而SPAGRM算法能够有效控制样本之间的亲缘相关性,提升分析准确性和运算速度。研究团队利用该算法分析了从UK Biobank电子健康记录数据中提取的79个纵向性状,发现了7,463个与表型均值显著相关的遗传位点,以及362个与表型动态变化方差密切相关的遗传位点。该算法的核心代码用C++进行优化,具备更好的运算效率与内存控制。
Nat Commun | 毕文健/岳伟华/张培培团队开发出分析纵向数据表型的GWAS新算法
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