Commun. Biol.｜利用HDX-MS解析PCI-34051 与HDAC8的结合及远端调控机制

本文研究了组蛋白去乙酰化酶8（HDAC8）与其选择性抑制剂PCI-34051的结合机制及远端调控机制。HDAC8是一种重要的表观遗传调控因子，与多种疾病相关。研究通过结合氢-氘交换质谱法（HDX-MS）、非变性质谱法（native MS）和长程分子动力学模拟（MD模拟）等方法，揭示了PCI-34051与HDAC8的结合比广谱抑制剂SAHA更为紧密，且能通过氢键作用网络影响远端调控位点。研究结果表明，PCI-34051的结合不仅稳定了HDAC8的结合通道，还通过L3结构桥梁传递稳定作用到远端区域。这些发现为开发更安全有效的选择性HDAC8抑制剂提供了新的思路。