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Mila唐建团队刘圣超：文本引导-蛋白质设计框架 | Nature Machine Intelligence

今日新材料 2025-03-30 09:25
文章摘要
本文介绍了由Mila唐建团队刘圣超等人提出的ProteinDT框架，该框架利用文本描述进行蛋白质设计，弥补了当前AI辅助蛋白质设计主要依赖序列和结构信息的不足。ProteinDT包括ProteinCLAP（对齐文本与蛋白表示）、表示生成器和序列解码器三个关键步骤，并在大规模数据集SwissProtCLAP上验证了其有效性。实验结果显示，ProteinDT在文本生成蛋白、零样本蛋白编辑和蛋白性质预测等任务中表现优异，尤其在零样本泛化和功能建模方面展现出强大潜力。研究还探讨了数据集质量和评估方式的挑战，并展望了零样本蛋白工程的未来可能性。
Mila唐建团队刘圣超：文本引导-蛋白质设计框架 | Nature Machine Intelligence
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