Nat Biotechnol丨何川/张理升等合作开发新的RNA修饰测序方法LIME-seq！

该研究由芝加哥大学何川、Bissonnette及香港科技大学张理升团队合作，开发了一种名为LIME-seq的新型RNA修饰测序方法，用于分析血浆中的无细胞RNA（cfRNA）修饰模式。研究背景指出，循环无细胞DNA（cfDNA）在癌症诊断中面临早期阶段浓度低、敏感性和特异性不足的挑战，而无细胞RNA（cfRNA）因其动态转录变化和疾病特异性表达模式，成为潜在替代方案。研究目的是通过LIME-seq检测微生物组来源的cfRNA修饰模式，以提升结直肠癌（CRC）早期诊断的准确性。研究结论表明，微生物组cfRNA的甲基化水平作为生物标志物，在CRC检测中表现出高准确性，尤其在早期阶段，且其修饰变化能更敏感地反映肿瘤微环境状态，为癌症诊断及其他健康应用提供了新思路。