Adv Sci丨内江师范大学王永明等团队研究揭示了鲤形目WGD进化机制

本研究由内江师范大学王永明等团队与根特大学Yves Van de Peer合作，发表在Advanced Science上，探讨了鲤形目全基因组复制（WGD）的进化机制。研究通过对两种泥鳅（金鳅和宜昌沙鳅）的高质量染色体水平基因组组装，结合20个鲤形目物种的比较基因组分析，重建了关键系统发育关系，并开发了一种新的亚基因组划分方法M3。该方法利用差异序列发散度快速准确地分配亚基因组，性能优于现有工具。研究发现金鳅中存在一个显著减少的亚基因组，其中多个候选基因具有谱系特异性的分子变化，可能具有适应性意义。研究全面展示了泥鳅的多倍体和亚基因组进化，揭示了鲤形目中重复WGD事件塑造的基因组复杂性，为脊椎动物基因组进化和适应性研究提供了宝贵资源。