血浆中来源于微生物的cfRNA修饰用于癌症早筛

研究背景：无创肿瘤检测技术如循环游离DNA(cfDNA)在癌症检测中已显示出潜力，但在早期癌症中cfDNA含量低限制了灵敏度。循环游离RNA(cfRNA)因其稳定性和丰度问题尚未受到足够关注。肠道微生物群在癌症发生中起重要作用，但缺乏高灵敏度的无创检测方法。研究目的：开发一种低输入、多位点RNA甲基化测序技术(LIME-seq)，以检测血浆cfRNA中的RNA修饰，并探索微生物来源cfRNA在癌症检测中的应用。结论：研究发现血浆cfRNA主要来源于tRNA及rRNA片段，其中20–40%的cfRNA属于肠道共生微生物。在结直肠癌患者中，微生物RNA修饰水平显著升高，基于这些修饰特征构建的分类模型在鉴别癌症患者方面表现出高准确性(AUC 0.98)。该技术还可应用于胰腺癌等非消化系统肿瘤，显示出广泛的应用前景。