JIPB | 系统发育重建揭示蔷薇类植物的演化蓝图：性状变迁、基因组加倍与多样性崛起

蔷薇类植物是被子植物中物种最为丰富的类群之一，具有极高的生态和经济价值。本研究通过整合203个新测转录组和两个浅层基因组数据，联合公共数据共取样316个蔷薇类物种，利用七组低拷贝核基因，系统重建了迄今最全面、分辨率最高的蔷薇类核基因系统发育树。研究澄清了多个深层系统关系中的核-质体冲突，检测到多个可能由远缘杂交、基因流或不完全谱系排序造成的系统发育不一致。同时，团队在20个科内共检测到27次全基因组复制事件，其中有18个为首次报导或对前人报导的发生位置的校正与更新。研究发现，多数全基因组复制事件集中发生在白垩纪-古近纪交界及其后期的古新世—始新世阶段，表明全基因组复制可能作为缓冲环境剧变、促进性状创新的机制，助力蔷薇类在重大地质气候事件后快速多样化。此外，研究还揭示了花瓣减少、雄蕊数目简化、子房由下位转向上位等一系列向简约化演化的趋势。