专家点评 | 张家民/高绍荣/史偈君/刘晓雨合作开发cFOOT-seq：单分子、单细胞分辨率的转录因子占位检测新平台

本文介绍了同济大学张家民、高绍荣、史偈君和刘晓雨教授团队合作开发的cFOOT-seq技术，该技术基于双链DNA脱氨酶SsdAtox，能够在全基因组范围内以单碱基分辨率同时检测染色质开放性、核小体定位和转录因子足迹。cFOOT-seq突破了传统方法在多靶点和灵敏度上的限制，适用于开放区和非开放区，并对低起始量样本表现出卓越性能。研究团队还开发了FootTrack分析平台，通过FOS和TFOS指标实现TF占位强度的精确量化。该技术在细胞重编程与染色质重塑等模型中展现出了良好的动态检测能力，为解析转录因子的动态行为及其与染色质环境的相互作用提供了坚实的技术基础。