Cell Res丨中国农业科学院左二伟研究证明了AlphaCD在高精度、高通量蛋白质功能表征中的应用

该研究由中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队完成，旨在解决蛋白质功能表征的效率和精度问题。研究通过实验表征了1100个APOBEC样家族胞苷脱氨酶（CDs）的多种催化特性，并构建了机器学习模型AlphaCD，该模型在预测催化效率、脱靶活性、靶位窗口和催化基序方面表现出高准确率。研究进一步利用AlphaCD对Uniprot数据库中的21,335个CDs进行了功能预测，并通过实验验证了预测的准确性。此外，研究还展示了如何通过诱变技术降低脱靶率，生成高保真、高效的胞嘧啶碱基编辑器。这一成果不仅为蛋白质功能的高通量、高精度表征提供了新工具，也为其他蛋白质的功能研究提供了策略。