Nat Genet | 王思远团队发表首个癌症单细胞三维基因组图集

本文介绍了耶鲁大学王思远团队在Nature Genetics上发表的研究，首次利用染色质描绘技术在组织原位单细胞层面观测三维基因组的折叠方式，构建了Kras驱动的小鼠肺腺癌和胰腺导管腺癌的三维基因组图谱。研究揭示了癌症进展中三维基因组的非单调、阶段特异性变化，包括早期“致密与收敛”的瓶颈阶段和后期“恢复与分化”的阶段。此外，研究团队开发了多个分析流程，如Trace2State和Trace2Biomarker，用于区分癌细胞状态和识别与三维基因组变化相关的基因，为癌症诊断、预后和治疗靶点预测提供了新视角。研究还发现Rnf2在三维基因组调控中的非典型功能。