Adv Sci丨上海交通大学沈永义等团队研究开发了动物病原体解码平台以促进病毒重叠群的检索和分析

背景：约75%的新兴病原体源自野生动物，但野生动物体内的病毒多样性仍未得到充分探索。研究目的：该研究旨在通过分析公开的高通量测序数据集，揭示野生动物中的新型病毒多样性、生物地理分布和宿主网络，并开发动物病原体解码平台以促进病毒重叠群的检索和分析。结论：研究分析了57,536个数据集，生成了约6.1345亿个组装重叠群，其中131,509个为潜在病毒重叠群。9,788个重叠群被归类为25个已知具有人畜共患病潜力的病毒家族，揭示了病毒分布在空间和宿主特异性方面的显著差异，以及病毒多样性与宿主生物多样性之间的正相关关系。50%的病毒序列与已知病毒的氨基酸同源性低于90%，表明可能存在新型病毒。宿主-病毒网络揭示了458个关联，其中67.9%尚未报道。此外，在多种动物中检测到禽流感病毒和SARS-CoV-2序列，凸显了野生动物中大量未表征的病毒多样性，强调了对野生动物-牲畜交界处进行监测的迫切需求。