西湖大学，最新Nature Protocols，中文署名！

本文针对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织在空间蛋白质组学分析中面临的空间分辨率低、蛋白质保留效率差等技术瓶颈，提出了一种新型的滤器辅助膨胀蛋白质组学（FAXP）方法。该方法通过结合水凝胶组织膨胀、激光捕获显微切割和质谱分析技术，实现了FFPE样本的高分辨率空间蛋白质组分析，能够达到单细胞乃至亚细胞水平的研究。实验结果表明，FAXP方法在线性膨胀倍数、蛋白质鉴定数量和酶切效率等方面均优于传统方法，且在多种组织类型中表现出良好的兼容性和重复性。尽管在超高分辨率分析和LCM收集效率方面仍有改进空间，但FAXP为癌症异质性、神经退行性疾病及细胞微环境等研究领域提供了强有力的工具，未来在临床样本的多组学整合研究中具有重要应用潜力。