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Nat Commun丨曾泽贤/孟元光合作团队系统评估亚细胞分辨率平台在人类肿瘤中表现

BioArt 2025-10-21 08:33
文章摘要
本研究背景聚焦于空间转录组学技术的快速发展，特别是测序型和成像型平台在分辨率和通量上的突破，但各平台性能缺乏系统性比较。研究目的是通过整合结肠癌、肝癌和卵巢癌临床样本的多组学数据，系统评估Stereo-seq v1.3、Visium HD FFPE、CosMx 6K和Xenium 5K四种前沿平台在灵敏度、特异性、细胞分割等关键指标的表现。结论表明成像型平台更适合单细胞水平分析，测序型平台适用于组织区域研究，而Stereo-seq v1.3在宿主-微生物互作中优势明显，同时开发的SPATCH平台为数据共享和模型开发提供支持，为不同生物学问题下的平台选择提供了实用指导。
Nat Commun丨曾泽贤/孟元光合作团队系统评估亚细胞分辨率平台在人类肿瘤中表现
查看文献： Systematic benchmarking of high-throughput subcellular spatial transcriptomics platforms across human tumors.
查看期刊：Nature Communications
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