【前沿进展】Nat Commun丨景乃禾、索生宝课题组合作构建小鼠胚胎原肠运动过程的时空多组学调控网络图谱

背景：胚胎发育，尤其是哺乳动物原肠运动阶段，是细胞命运决定和形态建成的关键时期，其分子调控机制复杂，单一组学难以全面解析。研究目的：景乃禾与索生宝团队合作，旨在通过整合多组学数据，构建小鼠胚胎原肠运动过程的时空多组学调控网络图谱，系统揭示胚层谱系命运决定和胚胎空间模式（如前-后、左-右体轴）建成的分子逻辑。结论：研究开发了BioCRE算法，构建了ST-MAGIC和ST-MAGIC(+)框架，首次整合了基因表达、染色质开放、转录因子与信号通路活性及细胞时空定位五维数据。发现了胚胎左-右体轴在“早期不对称”阶段即存在表观遗传预编程；阐明了轴中内胚层谱系发育中Eomes-Foxa2-Noto & Pou6f1等转录因子的时序接力调控规律，以及NODAL、WNT信号通路的时空活性变化；验证了NOTO和POU6F1在结点细胞成熟和纤毛发生中的关键作用。该工作为理解胚胎发育的底层调控逻辑提供了系统性框架和重要基础。