Cell |\u00A0消除“场效应”的膀胱癌尿液液体活检

背景：非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）是一种高度异质性的疾病，其标准疗法包括经尿道膀胱肿瘤切除术（TURBT）和卡介苗（BCG）灌注免疫治疗，但缺乏能准确预测BCG疗效的生物标志物。尿液肿瘤DNA（utDNA）检测有望用于微小残留病灶（MRD）监测，但正常尿路上皮中存在的“场效应”体细胞突变可能导致假阳性结果。研究目的：开发一种能排除场效应干扰、提高特异性的utDNA MRD检测方法，并用于识别NMIBC患者对不同治疗模式的分子应答类型。结论：研究团队开发了RePhyNERX算法，通过排除癌旁正常组织中存在的突变，精炼肿瘤突变谱，提高了MRD检测特异性。将其应用于接受TURBT及BCG治疗的NMIBC患者队列，成功识别出三类分子反应群体：手术应答者、BCG应答者以及无应答者。研究发现，BCG治疗后可检测的utDNA浓度与复发风险显著相关，且utDNA监测能有效区分复发风险。此外，研究证实尿液中的膀胱癌DNA浓度高于血浆，尤其在NMIBC中更具优势。这些发现凸显了场效应校正的液体活检方法在指导个体化治疗和揭示治疗环节生物标志物方面的潜力。