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Nat Commun |\u00A0王小滔团队提出三维基因组数据标准化新方法Raichu，揭示此前被忽视的调控型染色质互作

BioArt 2026-02-11 09:52

文章摘要

背景：真核生物中，基因转录常依赖远距离增强子与启动子在三维空间中的物理接触，但现有Hi-C数据分析中，传统标准化方法可能系统性地削弱与转录调控相关的较弱染色质互作信号。研究目的：复旦大学王小滔团队提出新的三维基因组数据标准化方法Raichu，旨在更有效地识别调控型染色质互作。结论：Raichu方法在多套高质量数据中识别到的染色质环数量接近或超过传统方法的两倍，新增环显著富集于增强子-启动子等调控相关互作，且与活跃调控标记高度重叠，提示以往关于染色质三维结构与转录调控关联有限的结论可能受数据分析方法影响，Raichu为重新认识三维基因组动态调控提供了新工具。

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查看文献： Boosting the detection of enhancer-promoter loops via normalization methods for chromatin interaction data
查看期刊：Nature Communications

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