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【前沿进展】Nat Commun | 王小滔团队提出三维基因组数据标准化新方法Raichu，揭示此前被忽视的调控型染色质互作

细胞世界 2026-02-11 17:05
文章摘要
背景：真核生物中基因转录依赖于增强子与启动子在三维空间中的物理接触，但染色质三维结构与基因转录调控之间的关联似乎不如预期紧密。研究目的：复旦大学王小滔团队针对Hi-C数据分析中标准化环节可能系统性地削弱调控型染色质互作信号的问题，提出新的标准化方法Raichu。结论：Raichu方法在保留距离衰减特性的同时避免对较弱互作的过度校正，能识别出更多富集于调控相关互作类型的染色质环，尤其在低测序深度数据中表现稳定，有助于重新评估三维基因组动态变化与转录调控的关系。
【前沿进展】Nat Commun | 王小滔团队提出三维基因组数据标准化新方法Raichu，揭示此前被忽视的调控型染色质互作
查看文献： Boosting the detection of enhancer-promoter loops via normalization methods for chromatin interaction data
查看期刊：Nature Communications
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