Nat\u00A0Commun丨熊云、Lin Tan等开发超高速多器官蛋白质组学方法，解析药物疗效与毒性

背景：随着系统生物学发展，现有蛋白质组学方法在分析深度与速度之间存在矛盾，限制了大规模样本的快速深入分析。研究目的：MD安德森癌症中心团队旨在开发一种超高速多器官蛋白质组学方法，以系统性解析药物疗效与毒性机制。该方法结合1 Th窄窗口数据非依赖采集（nDIA）、短梯度微流色谱和优化质谱参数，在1-2分钟内实现最高每分钟6,201种蛋白的鉴定速率，较以往方法提升两倍以上；同时设计高效样品制备流程，5小时内处理96个组织样本。作为应用示例，研究聚焦L-天冬酰胺酶（ASNase）的系统药理学，分析NSG小鼠13种组织共507个样本，鉴定定量11,472种蛋白质，构建ASNase处理后多器官细胞通路失调全景图。结论：该方法揭示了ASNase不仅影响氨基酸代谢，还抑制抗凝物质和胆固醇代谢，并发现大量组织特异性通路异常，为开发新型ASNase治疗策略奠定基础，同时展示了超高速蛋白质组学技术在系统生物学研究中的广泛应用潜力。