华中农业大学博士研究生(现河南农业大学青年教师)以第一作者身份在一区Top期刊上发表研究论文
植物研究进展
2026-02-25 23:04
文章摘要
本研究背景是植物染色质交互预测对理解基因调控至关重要。研究目的是开发一种基于卷积神经网络和Transformer的植物染色质交互预测模型PlantCTCIP,以提升预测精度。研究结论表明,PlantCTCIP在基因启动子近端交互和远端调控元件交互预测中,AUC均值分别比现有模型提高14.56%和9.6%,成功构建了四种作物的全基因组染色质互作图谱,并发现影响互作的基序及转录因子网络具有物种特异性,该模型可辅助识别远端元件调控的靶基因和挖掘功能位点。
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