PNAS｜岳家兴团队合作解析最早分化文昌鱼基因组，揭秘脊索动物基因组结构及重要免疫相关基因的演化历史

背景：文昌鱼作为头索动物亚门的代表性生物，与尾索动物和脊椎动物共同组成脊索动物门，其基因组未经历脊椎动物的全基因组倍增事件，被视为研究脊索动物早期演化的理想模式生物。研究目的：中山大学岳家兴团队及其合作者旨在通过解析最早分化的偏文昌鱼属物种鲁卡偏文昌鱼的基因组，阐明头索动物亚门的基因组结构和演化特征，并追溯Hox、TLR、NLR、RAG、MHC等重要基因的演化历史。结论：研究发现鲁卡偏文昌鱼基因组较大，主要由重复元件扩张导致；文昌鱼蛋白编码基因演化速率缓慢，基因组共线性高，鉴定出1214个高度保守的基因簇；Hox基因簇存在转座子插入和倒位事件；先天性免疫基因TLR和NLR发生物种特异性扩张，而适应性免疫相关基因RAG和MHC的原型形式已在文昌鱼中存在，但分布特征与人类存在差异。该研究为理解脊索动物早期演化和脊椎动物适应性免疫系统起源提供了新视角。