文章摘要
背景:人类基因组计划完成以来,单一参考基因组难以涵盖人群遗传多样性,导致复杂遗传变异识别困难,泛基因组应运而生,但高昂测序成本限制了样本规模。研究目的:为突破大规模泛基因组构建瓶颈,西湖大学杨剑团队开发了基于泛基因组的联合组装(PIGA)方法,结合高性价比混合测序策略,应用于千人泛基因组构建,旨在绘制详尽遗传变异图谱,赋能医学和群体遗传学研究。结论:研究成功构建了包含1,116个二倍体基因组的全球最大人类泛基因组,识别了逾4亿碱基对非参考序列,绘制了包含小变异、结构变异等在内的详尽遗传变异图谱,并开展泛变异eQTL分析,深化了对复杂遗传变异功能的认知,为疾病诊断和精准治疗提供了新范式。
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