Plant Com | 广西大学联合崖州湾国家实验室、西南大学共同开发植物激素反向对接数据库DockingDB

本文报道了广西大学、崖州湾国家实验室及西南大学联合团队在《Plant Communications》上发表的研究成果。研究背景：植物激素是调控植物生长发育的关键信号分子，但因体内浓度极低及技术限制，高通量识别其互作蛋白一直是重大挑战。研究目的：为系统解析植物激素与蛋白质的相互作用网络，研究团队开发了DockingDB在线反向对接数据库，并验证其有效性。该数据库整合了5794个植物蛋白质结构（涵盖拟南芥、小麦、玉米等），识别出18795个活性口袋，针对八类植物激素（生长素、细胞分裂素等）进行高通量反向虚拟筛选。以细胞分裂素中的激动素（Kin）为例，反向对接成功识别出已知受体，并结合分子动力学模拟及MST实验验证了9个新型互作蛋白。研究进一步聚焦于新鉴定的拟南芥AtPMT1（磷酸乙醇胺N-甲基转移酶），表明细胞分裂素可诱导其表达，且该基因敲除突变体表现出根发育受损等类似CK信号突变体的表型，并影响多种细胞分裂素代谢物水平。结论：该研究建立了一条高效鉴定植物激素新互作蛋白的技术路线，深化了对细胞分裂素代谢与信号转导网络的理解，为作物遗传改良提供了潜在的分子靶点。