Sci Adv | 任兵团队人类视网膜单细胞多组学图谱揭示眼病非编码风险变异调控机制

背景：视网膜是高度特化的神经组织，其异常与多种眼病相关。全基因组关联研究发现了大量眼病相关遗传风险位点，但多数位于非编码区，其如何通过影响特定细胞类型的调控元件和染色质结构参与疾病尚不明确。研究目的：通过构建人类视网膜单细胞多组学图谱，系统解析视网膜不同细胞类型的转录组、表观基因组和三维基因组特征，并鉴定细胞类型特异性顺式调控元件，进而结合深度学习解析眼病相关非编码风险变异的功能机制。结论：该研究成功绘制了包含超过58,000个细胞核的人类视网膜、黄斑及RPE/脉络膜组织的多组学图谱，鉴定了420,824个候选顺式调控元件，揭示了细胞类型特异性的染色质开放模式、DNA甲基化状态和三维基因组结构。通过人鼠比较，发现了保守与分化的视网膜调控程序。结合深度学习模型，研究能够预测非编码风险变异对不同细胞类型中染色质可及性的影响，并通过CRISPR实验进行了验证。该图谱和配套的公开资源（如Eye Epigenome Browser和分析工具）为理解视网膜细胞身份建立、眼病遗传机制及精准医学应用提供了重要基础。