NBE | 左二伟组利用蛋白结构预测和相似性聚类开发高效、无序列偏好性的胞嘧啶碱基编辑器

本文介绍了中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟研究组利用AlphaFold2进行蛋白结构预测和结构相似性聚类，成功开发出高效、无序列偏好性的胞嘧啶碱基编辑器。研究背景在于传统蛋白挖掘方法依赖于一级序列信息，忽视了三维结构信息的重要性，导致筛选效率和准确性降低。研究目的旨在通过AI技术提高新功能蛋白的挖掘效率，并解决现有编辑器存在的序列偏好性问题。研究结论显示，通过AlphaFold2预测和聚类，科研人员筛选出多种具有独特编辑特征的胞嘧啶脱氨酶，其中一些对靶位点的不同基序表现出无选择偏好性编辑，显著提高了CBE的编辑效率和应用范围，推动了CBE在生物医学和农业育种等领域的应用。