NBT | 蓝勋/李寅青/朱明团队合作推出通用型基因编辑脱靶检测技术

近年来，随着新型基因编辑工具如胞嘧啶碱基编辑器（CBE）、腺嘌呤碱基编辑器（ABE）和先导编辑器（PE）的开发，CRISPR/Cas系统在多个领域展现了巨大潜力。然而，脱靶效应成为了一个关键挑战，影响研究的准确性和基因治疗的安全性。清华大学蓝勋课题组与李寅青课题组合作开发了一种名为Tracking-seq的新型脱靶效应检测技术，该技术通过特异性识别与复制蛋白A（RPA）结合的单链DNA（ssDNA），并利用链特异性核酸酶消化双链DNA，构建链特异性ssDNA文库进行高通量测序，从而实现对多种编辑工具的脱靶检测。Tracking-seq不仅具有高召回率和精确度，还具有高度的泛用性，适用于多种编辑工具和不同的细胞类型及编辑环境。该技术为基因编辑在基因治疗等领域的安全应用提供了重要理论参考和技术支持。