北京大学｜从序列到生态：从基因组“阅读”出细菌之间是“朋友”还是“敌人”

本文探讨了微生物之间通过铁载体和其受体的特异性结合形成的“朋友”或“敌人”关系。研究通过分析假单胞菌属的基因组，揭示了铁载体合成基因和受体基因之间的“钥匙与锁”配对关系，这种关系决定了微生物之间的社会互动。研究团队开发了一种算法，能够通过基因序列预测微生物群落中的这种关系，并构建了一个包含近2000株假单胞菌的铁载体相互作用网络。研究发现，不同生活环境和习性的微生物铁载体互作网络存在显著差异，铁载体的多样性和利用方式直接影响了病原菌与非病原菌之间的竞争。这些发现为未来精确调控微生物群落提供了理论支持。