Plant Com | 贾继增/茹振钢/王道文/武亮等教授团队合作揭示转座元件驱动小麦亚基因组分化及助力驯化与改良机制

该研究以矮抗58高质量基因组为基础，通过比较基因组学、转录组学以及表观遗传学分析，揭示了转座元件（TE）通过驱动小麦亚基因组分化，促进小麦驯化与改良的调控机制。研究发现，六倍体小麦近85%的基因组由TE组成，且约有42%的TE家族在亚基因组间存在偏性分布。此外，约95%的基因与TEs共定位，这些多变的TEs可导致亚基因组间直系同源基因拷贝数变异、结构变异、甲基化变异和表达变异，极大地促进了亚基因组和同源基因的分化。研究还发现，在小麦基因组中，约50%的基因表现出拷贝数变异，且剩余的单拷贝亚基因组直系同源基因中约80%的位点表现出表达或亚功能分化。这些发现为理解多倍体物种的杂种优势和驯化改良提供了新的视角。