Protein & Cell 丨cFOOT-seq：单分子、单细胞分辨率的转录因子占位检测新平台

本文介绍了同济大学张家民课题组与高绍荣、史偈君、刘晓雨课题组合作开发的cFOOT-seq技术，该技术能够以单碱基分辨率在全基因组范围内同时检测染色质开放性、核小体定位和转录因子足迹。cFOOT-seq基于高效、低序列偏好的双链DNA脱氨酶SsdAtox，突破了传统方法在多靶点和灵敏度上的限制。研究团队还开发了FootTrack分析平台，用于精确量化转录因子占位强度，并支持重头足迹预测。利用cFOOT-seq，研究团队成功解析了不同细胞类型中转录因子的动态变化，为高通量解析转录因子结合的时空动态提供了强有力的工具。未来，该技术有望与高通量单细胞ATAC-seq及长读长测序平台结合，进一步提升足迹预测的精度与广度，推动转录调控机制研究进入新阶段。